Mise à disposition d'équipements - PCR

Mise à disposition d’équipements de biologie moléculaire

La plateforme iGenSeq de l’Institut du Cerveau à Paris met à disposition des équipements de biologie moléculaire sur une surface de 130 m². Nous réalisons une veille technologique et faisons évoluer le parc des équipements afin de répondre de façon réactive et personnalisée aux demandes des utilisateurs.

PCR quantitative en temps réel :

Les expériences de qPCR sont proposées sur la plateforme avec la technologie SYBR Green ou par sondes spécifiques en format 96 ou 384 puits.

Droplet digital PCR (ddPCR) :

Cette PCR est basée sur une technologie microfluidique de gouttelettes en émulsion eau-huile. Chaque échantillon est partitionné en 20.000 gouttelettes qui seront amplifiées par PCR, puis chaque gouttelette est analysée afin de permettre une quantification absolue du nombre de copies par microlitre.

Cette technique permet une quantification absolue de l’échantillon, sans référence à une courbe standard, plus sensible (permet l’étude de mutants rares) et plus précise que la qPCR (duplicats inutiles).

Ainsi, cette technique permet la recherche de variants rares, l’étude des variations du nombre de copies (CNV) ou d’expression génique, possible aussi à partir d’une cellule unique (single cell).

Le Système Bio-Rad dont dispose la plateforme est composé des modules suivants :

  • Automated droplet generator
  • C1000 Touch thermal cycler
  • QX200 droplet reader

La ddPCR est disponible en prestation ou en mise à disposition du matériel après formation initiale par le personnel de la plateforme.

Mise à disposition d’équipements :

Pour réaliser les expériences de biologie moléculaire, les appareils suivants sont disponibles:  

Avec réservation (veuillez contacter les membres de la plateforme)

qPCR 96 puits, technologie SybrGreen ou par sondes spécifiques, LightCycler 96 (Roche)

qPCR 384 puits, technologie SybrGreen ou par sondes spécifiques, LightCycler 480 (Roche)

droplet digital PCR Biorad (Automated droplet generator, C1000 Touch thermal cycler, QX200 droplet reader)

Sans réservation :

Tapestation 2200 (Agilent Technologies) Système d’électrophorèse capillaire à fluorescence

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Système d'électrophorèse à fluorescence Tapestation 2200
Système d’électrophorèse capillaire Labchip GX (Caliper)
(migration de produits de PCR)Plus d’informations cliquez ici
Spectrophotomètre Nanodrop 8000 (Thermo Scientific)

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Spark 10M (TECAN) Lecteur de microplaque en absorbance ou fluorescence

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lecteur de microplaques Spark 10M
Spectrophotomètre/Fluorimètre DS-11 FX (Denovix) et Fluorimètre Qubit : les appareils sont mis à disposition, l’utilisateur doit disposer des réactifs nécessaires.

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6 thermocycleurs (3 Eppendorf, 3 Applied Biosystems)

Bioruptor Pico (Diagenode)