NextSeq 500

Séquençage EXOME

A l’Institut du Cerveau, grâce à l’expérience de la plateforme iGenSeq sur le séquençage, acquise depuis 2011, et l’achat de séquenceurs   Nextseq 500 (Illumina) et  NovaSeq 6000 (Illumina), nous proposons le séquençage d’exomes humains avec les enrichissements suivants :

SeqCap EZ Exome v3.0 (Roche) : Capture de 64 Mb, couvrant plus de 20.000 gènes, les régions flanquantes de nombreux exons et des miRNA.

SeqCap EZ MedExome (Roche) : Capture de 47 Mb, avec une couverture homogène des gènes médicalement pertinents.

SeqCap EZ Prime Exome (Roche) : Capture de 37 Mb, avec une couverture homogène des gènes médicalement pertinents et 340 SNP informatifs.

Twist Human Core Exome (Twist Bioscience) : Capture de 33 Mb de régions codantes hautement conservées, basées sur CCDS.

 

séquençage kit librairie quantité volume contrôles qualité à faire par le client sondes de capture
exome KAPA Hyperplus; SeqCap EZ HyperCap (Roche) 100 ng d’ADN 35 µl Qubit + gel d’agarose Exomes v3; MedExome; Prime Exome (Roche)
exome Twist Human Core Exome (Twist Bioscience) 100 ng d’ADN 10 µl Qubit + gel d’agarose Twist Human Core Exome + RefSeq

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