regroupant 9 plateformes technologiques de pointe
À l’Institut du Cerveau, grâce à l’expérience de la plateforme iGenSeq sur le séquençage, acquise depuis 2011, et suite à l’achat de nos séquenceurs, nous pouvons séquencer des génomes entiers de taille variable. Nous vous proposons de séquencer vos génomes d’intérêt, qu’ils soient humains, animaux, végétaux ou bactériens.
Séquençage de génome humain :
Le séquençage de génome humain est proposé sur le NovaSeq, avec jusqu’à 24 génomes par run selon les cartouches (150 pb par reads et 20 milliards de reads) et la profondeur désirée. L’ADN ne doit pas être dégradé afin d’avoir un séquençage de bonne qualité.
| séquençage | kit | quantité | volume | contrôles qualité à faire par le client |
| génome humain | Illumina DNA Prep | 150 ng | 30 µl | Qubit + gel d’agarose |
| génome humain |
Illumina DNA PCR-Free Library Prep |
200 ng | 50 µl | Qubit + gel d’agarose |
Séquençage de génome non humain :
Le séquençage de génome de tout autre organisme peut être réalisé sur le NextSeq ou le Novaseq. Le nombre d’échantillon déposé sur un run dépend de la nature de l’échantillon de départ, et de la profondeur de séquençage voulue, du séquenceur et de la cartouche.
| séquençage | technique | quantité | volume | contrôles qualité à faire par le client |
| génome | Illumina DNA Prep | 20 à 150 ng | 30 µl | Qubit + gel d’agarose |
| génome | KAPA Hyperplus | 100 ng | 35 µl | Qubit + gel d’agarose |
|
génome |
Illumina DNA PCR-Free Library Prep |
200 ng | 50 µl | Qubit + gel d’agarose |
