Séquençage à haut débit

Le séquençage à haut débit ou next-generation sequencing (NGS) est une méthodologie moléculaire qui permet le séquençage rapide d'exomes, de génomes, d'ARN...

La plateforme iGenSeq à l’Institut du Cerveau (Paris) possède 3 séquenceurs Illumina. Ces appareils sont disponibles pour des prestations. iGenSeq est certifiée ISO9001:2015 depuis 2015 sur les prestations de séquençage haut débit. 

1 séquenceur MiSeq (Illumina)  

Séquenceur à moyen débit, pouvant générer jusqu’à 15 Gb de données et 25 millions de reads par run (300 bp max par read).

Disponible uniquement pour les prestations.

1 Novaseq X plus ILLUMINA

Séquenceur à haut débit en lectures courtes (300 cycles maximum), pouvant générer de 160 à 7800Gb de données et faire descendre le prix d’un Séquençage humain total à moins de 380€ HT. Avec 2 Flowcell disponibles, cette machine permet de réaliser plus de 120 WGS humain en 48h

Nextseq 2000 ILLUMINA

Séquenceur à haut débit en lectures courtes (600 cycles maximum), pouvant générer de 10 à 360Gb de données. Idéal pour les petites cohortes ou pour des phases pilotes.

Chromium 10X genomics

Système d’encapsulation cellulaire pour la réalisation d’expériences en cellules uniques. Capacité maximale de 20000Cellules en entrée, soit 10000 environ exploitables après séquençage. iGenSeq propose sur cet appareil, uniquement l’application 3’ expression sur cellules ou noyaux en prestation complète. Les autres applications sont possibles mais le client devra fournir les kits associés.